5月12日、13日，国家防总、水利部连续发出两个紧急通知，贯彻落实党中央、国务院关于抗震减灾工作的重要指示，及时部署地震灾区防洪工程安全工作。通知要求，震区各级水利、防汛部门：
一是要立即组织技术人员和工程管理单位，迅速对水库（尤其是病险或在建水库）、水电站、堤防、闸坝、堰塞湖等开展拉网式排查研判，确保险情及时发现、及时抢护。
二是对发生险情的水库等防洪工程，要立即组织专家会诊，制定抢险方案，落实抢险队伍和抢险物资，及时控制险情。对重大险情可能发生的危险地区，要迅速转移下游和受威胁的群众，确保人员生命安全。
三是对一些难以有效排除险情的水库、水电站和堰塞湖，要采取果断措施，加大泄量，尽快降低库（湖）水位或腾空库容，确保万无一失。
四是要加强雨水情监测预报，特别要应对好强降雨可能引发的山洪、滑坡、崩塌对水库、水电站、堤防等工程造成的不利影响，加强水利工程的调度运用，及时启动应急预案，保障工程安全运行。
五是各地要及时上报防洪工程的震损情况及处置措施。
